Il template protostar è quello che trovi dopo aver installato joomla 3, se non lo hai cancellato lo trovi in gestione template.
ti ripeto che le mie sono solo ipotesi, le stesse che farebbe un medico se qualcuno gli parlasse di alcuni sintomi di una persona che non è presente
non abbiamo notizie di bug
Forse dovresti a reinstallare joomla e icagenda in uno spazio di test e verificare, questi problemi quando si sono presentati, hanno rivelato dei bug si, ma del sito di come era configurato o di qualche file di joomla corrotto o un installazione di joomla dove si erano ripetutamente installati e disinstallati componenti ed extensioni varie, di installazioni di framework per template (warp, t3, gantry) disinstallati non completamente, di una installazione di joomla migrata che si è portata dietro i problemi della vecchia versione.
Anche template costruiti con i famosi software per la realizzazione di template per joomla hanno dato qualche problema, dovendo correggere a mano delle classi che venivano sovrascritte
Insomma la casistica è varia e se tu non fai quelle prove che ti ho suggerito stiamo a parlare del nulla.
Joomla 3 insieme al template protostar e icagenda, devono funzionare perfettamente.
Protostar, per la versione 3, è il template di riferimento dove vengono testate tutte le estensioni, difficile che con questo template ci sia un problema. Altra cosa è con altri template di cui gli sviluppatori possono solo ricevere feedback positivi o negativi.